Gydytoja konsultuoja pacientus, sergančius širdies ir kraujagyslių ligomis, atlieka  širdies echoskopinius tyrimus, skiria ir vertina Holter monitoravimą.

Nuo 2019 m. dirba gydytoja kardiologe Klaipėdos jūrininkų ligoninėje.

Domėjimosi sritis: širdies aritmijos, širdies nepakankamumas, paveldimos širdies ligos. Konsultuoja ir tiria pacientus su sąmonės netekimo epizodais.

Gyd. Ernesta Monkūnienė nuolat gilina žinias ir tobulina  kvalifikaciją nacionalinėse ir tarptautinėse konferencijose.

Gydytoja yra Lietuvos kardiologų draugijos narė.